要把凈化工程實施好，要把其中的關鍵點空調系統處理好。所以企業就找專業的凈化工程公司來設計最適合工程的空調暖通相施工技術以用于凈化室，同時也要對凈化室的保護結構和相應的使用流程的重點考量，否則會對空調系統的使用產生非常大的影響。
    1.確定其凈化等級、系統劃分。
    空調系統的設計方案和投資的多少直接取決于潔凈度等級對其的影響程度，因此在結合實際使用情況與使用要求的基礎之上，要對潔凈度等級不同的凈化空調系統進行分別設置，以降低能耗及投資，使該系統設計合理化、經濟化。
    2.正壓控制。
    保持一定程度的正壓值是潔凈室必須具備的條件之一，其目的是不被外界環境所污染，它的原理是使凈化空調系統的送風量要比回風、排風量的總和大來實現。好的凈化工程中，除了在通風管道上設置相關風量調節閥以外，還要設置正壓控制設備，如回風口處安裝空氣阻層、壓差電風量調節裝置或定量風閥。其中定量風閥必須考慮其安裝距離，保證其有效發揮作用。
     3. 氣流組織。
    凈化工程氣流組織不同于一般的空調房間，其對潔凈度有著重大的影響，好的凈化工程應從制造工藝對潔凈度的需求出發，基于節約的原則和配合建筑物的實際使用情況來決定。
     4. 消聲減振。
    凈化型空調系統風壓較一般空調的要高，同時發生的振動情況和噪聲的可能性也較大，好的凈化工程應著重于解決噪聲和振動所帶來的影響，防止振動、噪音從管道中傳遞出，以滿足潔凈室的具體使用要求。
   
    5.管道附件。
    凈化型空調的制作在選擇材料上，應以不容易積灰塵、方便清潔的光滑表面為選擇標準進行選材。
    設計、施工、驗收是凈化工程的三個環節，好的設計方案為凈化工程的實施打下了良好的基礎。凈化工程空調系統在日常運行期間，還要定期對其溫、濕度、正壓數值、三級效率過濾裝置的積灰塵情況進行檢查，對過濾附件進行定期更換，對人與物進行嚴格凈化。